Para grupos de estudiantes de enseñanza básica y media, ECIM ha ofrecido tours guiados de la estación marina, charlas y oportunidades de participar activamente en experimentos de ecología marina. El programa de extensión de mayor magnitud realizado en ECIM fue apoyado por EXPLORA, una iniciativa nacional de educación de jóvenes financiada por CONICYT que incentiva a los estudiantes a pensar en forma crítica sobre ciencia y tecnología. Profesores y estudiantes de post-grado de ECIM diseñaron experimentos demostrativos y actividades interactivas para captar el interés de los escolares en ecología marina, 
el método científico, y la importancia de valorar los ecosistemas marinos locales. Mientras aprendían conceptos amplios sobre el océano y organismos marinos locales, los estudiantes también tuvieron la oportunidad de aprender sobre áreas marinas protegidas y uso sustentable de recursos marinos directamente desde la institución que abrió este campo en Chile.
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